Du "stöberst" doch nicht etwa über den Explorer?
Das mache ich schon lange überhaupt nicht mehr. Playerprogramme wie z.B. Foobar 2000 verwalten Deine Titel komplett über eine Art Datenbank. Da kannst Du suchen, "stöbern", umsortieren - was immer Du willst - ohne Angst zu haben, das Dateien/Ordner verschoben werden. Das passiert erst, wenn Du dem Programm die ausdrückliche Anweisung dafür gibst.
Alternativ - das mache ich auch gern...
Gehe mal auf Deine Taskleiste. Dann Rechtsklick - Symbolleisten - Neue Symbolleiste und wähle mal dort das Hauptverzeichnung Deiner Musiksammlung aus.
Und schon kannst Du ohne weiteren Klick in Deiner Sammlung stöbern - sie öffnet sich nämlich über der Taskleiste wie ein Menü. Doppelklick auf einen Titel bewirkt, das der zugehörige Player samt Titel gestartet wird oder in dessen Queu aufgenommen wird.
Und zu Deine Backup-Software: Das neue Acronis kann das, wenn Du "Dauerbackup" aktivierst (keine Ahnung, wie das jetzt richtig heißt). Es erfasst jede Änderung im laufenden Betrieb und kann diese bei Bedarf Rückgängig machen.