Ganz einfach:
Viele Programme sehen eine 100% Vollausteurung schon als Clipping an. Also sobald auch nur ein einziges Sample den Maximalwert erreicht. Eine solche Vollausteuerung ist zwar nicht unbedingt "erstrebenswert", hat aber in dem Falle auch noch nichts mit Clipping zu tun.
Auch 2 Samples hintereinander müssen noch kein Clipping bedeuten. Nämlich wenn der ansteigende Teil einer Kurve auf dem ersten, der abfallende Teil auf dem zweiten Sample liegt - also der Scheitelpunkt genau dazwischen.
Auch wenn dieser Scheitelpunkt dazwischen wesenentlich höher liegen kann als besagte 100%, muß noch kein Clipping vorliegen, da die Samplewerte selber ja korrekt erfasst sind. Die Frage ist dann eher, wie die Soundkarte damit umgeht...
Alternativ gibt es auch Programme, die erst dann Clipping melden, wenn mehr als 2 Samples hintereinander auf Maximalwert liegen. In dem Falle kann man ziemlich sicher sein, das wirklich echtes Clipping vorliegt.
Sobald Du aber mit einem beliebigen Programm die Gesamtausteuerung verringerst, wird das Clipping dann zwar nicht mehr gemeldet, ist aber nach wie vor vorhanden (nur eben leiser)...